Sa tSeapáin ársa, bhí cogadh leanúnach idir dhá chaisleán laochra - samurai agus ninja. Beidh tú sa chluiche Ninja Runner troid ar thaobh an Ordú Ninjas. Fuair do charachtar ordú ó cheann an ordaithe chun taiscéalaíocht a dhéanamh i bhforaois amháin, i gcás ina bhféadfadh na dílseachtaí samurai a cheilt. D'éirigh do laoch isteach sa bhforaois go tromchúiseach agus rith sé ar feadh an chosáin. Fanann mórán contúirtí agus gaistí air ar a bhealach. Caithfidh tú do charachtar a rialú tú a léim agus ní bheidh sé ag dul isteach sna gaistí sin. Má thagann tú thar namhaid saighdiúirí, caithfidh tú iad a scriosadh le cabhair ó chlaíomh. Déan na míreanna éagsúla a thagann isteach sa bhealach a bhailiú.
