Tá an Banphrionsa Peach fuadach arís, ní féidir le Bowser a suaimhneas, agus tá sé in am dul ar scor, ach fós ann, áilleacht a thabhairt dó. Mario riachtanais a bhuail an bóthar, agus tá sé freisin nach bhfuil an chéad úire. Don chéad uair, bhí an pluiméir in amhras faoina chumais agus chinn sé cuireadh a thabhairt do Sonic chun cuidiú, a fhios aige conas is féidir leis rith go tapa agus léim ard. Idir an dá linn, cé go dtagann Sonic, is féidir leat a rialú Mario agus cabhrú leis boinn a bhailiú agus léim ar henchmen Bowser ar. Ansin, is féidir leat aistriú chuig Sonic, ach beidh sé fáinní a bhailiú, ach tá an dá laochra an sprioc céanna - a shábháil ar an banphrionsa i Super Mario agus Sonic.