Ní fada ó Naruto an déagóir suaimhneach nach bhfuil eolas aige ar a chumais, ach tá sé deacair fós eispéireas ciallmhar ninja a ghlaoch air. Mar sin féin, tá foireann aige agus tá siad réidh chun troid leis na fórsaí dorcha chun an ceart a bheith ina gceannaire iontach shinobi. Ag céim an chluiche Ninja Runner Runato, is féidir leat cabhrú leis an laoch na chéad naimhde eile a ruaigeadh, nach dtriomaíonn a sreabhadh. Is iontach an líon comhraic é agus cuireann siad an laoch ar luas. Rithfidh sé go gasta, agus cuirfidh tú air freagairt do chonstaicí atá ag teacht, beochan agus neamhbheo.