Ní dhéanann aon duine díospóid faoi éachtaí na Ninja Turtles Déagóirí Mutant agus na Power Rangers, áfach, ní raibh siad in ann aontú eatarthu féin agus éilíonn gach grúpa a bheith níos fearr. Chun a fháil amach cé hé an duine is fearr, chinn na laochra troideanna a shocrú ina measc féin agus tosóidh siad chomh luath agus a théann tú isteach sa chluiche Ninja Turtles Déagóirí Mutant VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash. Roghnaíonn tú na trodaithe a bheidh ar an gcéad dul isteach sa réimse. Tar éis sraith cathanna, níor cheart go bhfanfadh ach buaiteoir amháin. Ní chuireann aon duine iallach ort fréamh do dhuine éigin, roghnaíonn tú laoch duit féin agus cuirfidh tú chun cinn é, ag cabhrú le gach iomaitheoirí a shárú i Ninja Turtles Déagóirí Mutant VS Power Rangers: Ultimate Hero Clash.