Tá deis ag Sonic déileáil lena sean-namhaid Knuckles. Fuair an ghráinneog gorm eolas gan choinne faoi shuíomh a chéile comhraic agus tá sé ar intinn aige dul ann. In éineacht lena gcara agus cúntóir Tails, rachaidh na laochra chuig an oileán ar eitleán. Tar éis tuirlingthe, buailfidh siad le Knuckles, ach imíonn sé go tapa. Ní mór duit cabhrú Sonic agus a chara chase an villain. Chuir sé go leor gaistí ar an oileán ionas nach bhféadfadh aon duine teacht suas leis, ach ní féidir Sonic a stopadh, agus beidh tú ag rialú go docht ar ghluaiseacht an laoch, rud a chosc ó rith isteach i spící géara. Bailigh fáinní, beidh siad úsáideach i gcónaí don laoch i Sonic 3 & Knuckles.